江苏省农业科学院六合基地坐落于南京市六合区竹镇镇金磁社区，于2006年开始建设。占地面积3316亩，总投资近3亿元，是全国一流综合性的农业科研与产业平台。

建有1000亩旱地作物试验区、1000亩农产品种植区和200多亩设施大棚，猪、羊、兔、禽养殖场；建有办公楼3080平方米、共有办公室36间，实验室18间，小型会议室2间，学术报告厅1间；建有职工宿舍2500平方米；建有食堂600平方米 ，可容纳200人就餐 。

六合基地主要展示我院研发的动植物新品种、新技术、新模式，运用循环经济理念，遵循“减量化、再利用、再循环”的原则，通过技术集成和机制创新，着力构建农牧结合、物质能量高效利用的循环型生态农业示范区。

科普教育是基地最重要的功能之一，一直秉承着“科技创新、服务三农、科学普及”宗旨，全年向公众免费开放，面向社会和公众展示最新农业科研成果，为做好科学普及工作做出积极贡献。2014年获批全国首批“国家农业科技创新与集成示范基地”，2014年和2020年连续2轮被授予江苏省科普教育基地。

六合基地目前主要有六大科技创新功能：

一是动物育种及养殖技术研究：相关团队主要开展动物新品种选育及养殖技术研究。先后成功选育了“苏钟猪”、“波杂羊”等新品种，研制了“发酵床养猪技术”“玉米秸秆青贮技术”等新技术，为循环农业技术体系提供支撑。

二是蔬菜、果树新品种选育及栽培技术研究：相关研究团队主要在此从事蔬菜和果树等园艺类作物种质资源保存、创新及相关技术研究。包括茄果类、叶菜类、瓜类等；果树包括薄壳山核桃、猕猴桃等；各研究团队紧密围绕高效设施农业发展需求，先后育成120多个适合设施栽培的园艺新品种。

三是循环农业技术研究：相关研究团队主要开展农林废弃物高值化利用、功能肥料产品研发、绿色循环农业等技术和产品的熟化与中试，同时作为六合动物科学基地种养结合循环农业关键节点，承担基地农林废弃物处理任务。

四是大田作物育种及栽培技术研究：进驻基地的相关研究团队以“高产、优质、节本、高效、安全”为目标，致力于粮棉油等作物种质资源保存、创新及相关技术研究。先后育成并审定数十个优良品种，如“宁麦”系列小麦、“苏糯”系列玉米、“宁紫”系列山芋，“苏彩”系列彩棉等等大宗作物品种。

五是转基因管理及技术研究：试验区占地面积150亩。始建于2009年，是院承担转基因科研专项、人才培养、相关学科建设的重要平台之一。在基础设施投入、相关制度、管理队伍建设上已经具备了开展转基因重大项目研究的要求。

六是果蔬加工技术研究：该区占地面积4940平方米，其中中试车间2600平方米，实验冷库及产品贮藏冷库等配套设施用房2342平方米。试验区建有速冻食品加工、即食食品加工及休闲食品加工生产线3条，以及产品理化分析及品质检测实验室等，主要开展特色农产品保鲜加工产业化技术集成与示范研究工作。经过多年研究，重点突破了鲜食玉米等特色农产品玻璃态冻藏及低损解冻关键技术，钝酶护色、高温高压调理杀菌增香的真空软包装技术，以及高效富集、多物理场组合干燥等深加工核心技术，建立了加工专用品种品质评价标准与筛选技术，集成了特色农产品保鲜加工与全程质量控制产业化技术体系。